Actinobacteria
 |
Ez a szócikk vagy szakasz lektorálásra, tartalmi javításokra szorul. A felmerült kifogásokat a szócikk vitalapja részletezi (vagy extrém esetben a szócikk szövegében elhelyezett, kikommentelt szövegrészek). Ha nincs indoklás a vitalapon (vagy szerkesztési módban a szövegközben), bátran távolítsd el a sablont! Csak akkor tedd a lap tetejére ezt a sablont, ha az egész cikk megszövegezése hibás. Ha nem, az adott szakaszba tedd, így segítve a lektorok munkáját! |
 Actinobacteria
| ||
|---|---|---|
| ||
| Rendszertani besorolás | ||
| ||
| Hivatkozások | ||
 Commons
A Wikimédia Commons tartalmaz Actinobacteria témájú kategóriát. |
Az Actinobacteriumok a Gram-pozitív baktériumok családjába tartoznak. Lehetnek földi vagy vízi. Nagy gazdasági jelentőségűek az emberek számára, mivel a mezőgazdaság és az erdők a talajrendszerekhez való hozzájárulásuktól függenek. A talajban elősegítik az elhalt organizmusok szerves anyagainak lebontását, így a molekulák újból felvehetők a növények által. Míg ezt a szerepet a gombák is betöltik, az Actinobacteriumok sokkal kisebbek és valószínűleg nem ugyanazt az ökológiai rést foglalják el. Ebben a szerepben a telepek gyakran kiterjedt micéliumot növesztenek, akárcsak egy gomba, és a védettség egyik fontos rendjének neve, az Actinomycetales (az aktinomicéták) azt tükrözi, hogy sokáig gombának hitték őket. Egyes talajaktinobaktériumok (például a Frankia ) szimbiotikusan élnek a növényekkel, amelyek gyökerei áthatolnak a talajon, nitrogénet kötve a növényekért cserébe a növény egyes szacharidjaihoz való hozzáférésért. Más fajok, például a Mycobacterium nemzetség számos tagja, fontos kórokozók .
Az Actinobacteriumok iránti talajszerepük iránti nagy érdeklődésen túl sok mindent meg kell még tanulni róluk. Bár jelenleg elsősorban talajbaktériumként értik őket, az édesvízben előfordulhat, hogy nagyobb mennyiségben fordul elő. Az aktinobaktériumok az egyik domináns bakteriális phyla, és az egyik legnagyobb baktérium nemzetséget, a Streptomyces-t tartalmazza. A Streptomyces és más aktinobaktériumok a talaj biológiai pufferelésének fő hozzájárulói. Számos antibiotikum is ezek forrása.
Noha a legnagyobb és legösszetettebb baktériumsejtek egy része az Actinobacteriumokhoz tartozik, a tengeri Actinomarinales csoportról azt írták, hogy a legkisebb szabadon élő prokarióta sejtekkel rendelkezik.
Egyes szibériai vagy antarktiszi aktinobaktériumok állítólag a Föld legöregebb élő organizmusai, amelyek félmillió évvel ezelőtt örökfagyba fagytak. Az élet tüneteit a CO CO felszabadulás a 640 kya vagy annál fiatalabb permafrost mintákból.
A legtöbb orvosi vagy gazdasági jelentőségű Actinobacterium az Actinobacteridae alosztályba tartozik, és az Actinomycetales rendjébe tartozik. Míg ezek közül sok emberben betegséget okoz, a Streptomyces az antibiotikumok forrásaként figyelemre méltó.
Az Actinomycetalesben nem szereplő Actinobacteriumok közül a Gardnerella az egyik leginkább kutatott. A Gardnerella osztályozása ellentmondásos, és a MeSH mind Gram-pozitív, mind Gram-negatív szervezetként katalogizálja.
Az aktinobaktériumokat, különösen a Streptomyces spp. Számos bioaktív metabolit termelőjeként ismerik el, amelyek az ember számára hasznosak az orvostudományban, mint például antibakteriális szerek, gombaellenes szerek, vírusellenes szerek, antitrombotikus szerek, immunmodifikátorok, daganatellenes szerek és enzimgátlók; és a mezőgazdaságban, ideértve a rovarölő, gyomirtó, gombaölő és a növények és állatok növekedését elősegítő anyagokat. Az orvostudományban fontos aktinobaktériumokból származó antibiotikumok közé tartoznak az aminoglikozidok, antraciklinek, klóramfenikol, makrolidok, tetraciklinek stb.
Az aktinobaktériumok DNS-ében magas guanin- és citozintartalom található. Az Actinobacteriumok G + C tartalma akár 70% is lehet, bár egyesek alacsony G + C tartalommal bírhatnak.
A glutamin-szintetáz szekvencia elemzését javasolták az Actinobacteriumok filogenetikai elemzéséhez.
Törzsfejlődés
A filogenitás a 'The All-Species Living Tree' Project 16S rRNS-alapú LTP 123. kiadásán alapul.
Rendszertan
Megjegyzések: ♠ Az Országos Biotechnológiai Információs Központban (NCBI) található törzsek, amelyek nem szerepelnek a Nómenklatúrában álló prokarióta nevek listájában (LSPN)
- Species "Cathayosporangium alboflavum" ♠ Runmao et al. 1995
- Species "Candidatus Planktophila limnetica" Jezbera et al. 2009
- Species "Tonsillophilus suis" ♠ Azuma and Bak 1980
- Class Rubrobacteria Suzuki 2013 (Rubrobacteridae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Order Rubrobacterales Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Family Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997
- Order Rubrobacterales Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Class Thermoleophilia Suzuki & Whitman 2013 (Thermoleophilidae)
- Order Gaiellales Albuquerque et al. 2012
- Family Gaiellaceae Albuquerque et al. 2012
- Order Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009
- Family Thermoleophilaceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
- Family Conexibacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Family Patulibacteraceae Takahashi et al. 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Family Solirubrobacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi et al. 2009
- Order Gaiellales Albuquerque et al. 2012
- Class Coriobacteriia Konig 2013 emend. Gupta et al. 2013 (Coriobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Order Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
- Family Atopobiaceae Gupta et al. 2013
- Family Coriobacteriaceae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Eggerthellales Gupta et al. 2013
- Family Eggerthellaceae Gupta et al. 2013
- Order Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
- Class Acidimicrobiia Norris 2013 (Acidimicrobidae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Order Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Family Acidimicrobiaceae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Family Iamiaceae Kurahashi et al. 2009
- Family "Microthrixaceae" Joseph et al. 2003
- Order Acidimicrobiales Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Class Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013 (Nitriliruptoridae Kurahashi et al. 2010)
- Order Egibacterales Zhang et al. 2016
- Family Egibacteraceae Zhang et al. 2016
- Order Egicoccales Zhang et al. 2015
- Family Egicoccaceae Zhang et al. 2015
- Order Euzebyales Kurahashi et al. 2010
- Family Euzebyaceae Kurahashi et al. 2010
- Order Nitriliruptorales Sorokin et al. 2009
- Family Nitriliruptoraceae Sorokin et al. 2009
- Order Egibacterales Zhang et al. 2016
- Class Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 (Actinobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Species ?"Boyliae praeputiale" ♠ Yates et al. 2002
- Order ?"Actinomarinales" Ghai et al. 2013
- Family "Actinomarinaceae" Ghai et al. 2013
- Order Acidothermales Sen et al. 2014
- Family Acidothermaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi et al. 2009
- Order "Catenulisporales" Donadio et al. 2012 (Catenulisporineae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009)
- Family Actinospicaceae Cavaletti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
- Family Catenulisporaceae Busti et al. 2006 emend. Zhi et al. 2009
- Order "Streptomycetales" Kampfer 2012 (Streptomycetineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Family Streptomycetaceae Waksman & Henrici 1943 emend. Zhi et al. 2009
- Order Geodermatophilales Sen et al. 2014
- Family Geodermatophilaceae Normand 2006 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Frankiales Sen et al. 2014 (Frankineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Motilibacteraceae Lee 2013
- Family Cryptosporangiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Family Frankiaceae Becking 1970 emend. Zhi et al. 2009
- Family Sporichthyaceae Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Nakamurellales Sen et al. 2014
- Family Nakamurellaceae Tao et al. 2004 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order "Kineosporiales" Kampfer 2012 (Kineosporineae Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Kineosporiaceae Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order Micrococcales Prevot 1940
- Family Intrasporangiaceae
- Family Microbacteriaceae
- Family Cellulomonadceae
- Family Promicromonosporaceae
- Family Sanguibacteraceae
- Family Rarobacteraceae
- Family Jonesiaceae
- Family Bogoriellaceae
- Family Beutenbergiaceae
- Family Ruaniaceae
- Family Actinomycetaceae
- Family Demequinaceae
- Family Dermabacteraceae
- Family Brevibacteriaceae
- Family Micrococcaceae (incl. Bifidobacteriaceae)
- Order "Propionibacteriales" Patrick & McDowell 2012 (Propionibacterineae Rainey et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009)
- Family Nocardioidaceae
- Family Propionibacteriaceae
- Order "Streptosporangiales" Goodfellow 2012 (Streptosporangineae Ward-Rainey et al. 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Streptosporangiaceae
- Family Nocardiopsaceae
- Family Thermomonosporaceae
- Order "Jiangellales" Tang et al. 2012 (Jiangellineae Tang et al. 2011)
- Family Jiangellaceae Tang et al. 2011
- Order "Glycomycetales" Labeda 2012 (Glycomycetineae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009)
- Family Glycomycetaceae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt 1997 emend. Zhi, Li & Stackebrandt 2009
- Order "Micromonosporales" Genilloud 2012 (Micromonosporineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009; Actinoplanales]
- Family Micromonosporaceae
- Order "Pseudonocardiales" Labeda & Goodfellow 2012 (Pseudonocardineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Labeda et al. 2011)
- Family Pseudonocardiaceae
- Order "Corynebacteriales" Goodfellow & Jones 2012 (Corynebacterineae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009<meta />; Mycobacteria)
- Family Segniliparaceae
- Family Nocardiaceae
- Family Dietziaceae
- Family Corynebacteriaceae
- Family Tsukamurellaceae
- Family Mycobacteriaceae
Jegyzetek
- ↑ (2008. január 1.) „Evidence excluding the root of the tree of life from the actinobacteria”. Mol. Biol. Evol. 25 (1), 1–4. o. DOI:10.1093/molbev/msm249. PMID 18003601.
- ↑ (2011) „Metagenomics of the water column in the pristine upper course of the Amazon river”. PLOS ONE 6 (8), e23785. o. DOI:10.1371/journal.pone.0023785. PMID 21915244.
- ↑ C.Michael Hogan.. 2010. Bacteria. Encyclopedia of Earth. eds. Sidney Draggan and C.J.Cleveland, National Council for Science and the Environment, Washington DC Archiválva 2011. május 11-i dátummal a Wayback Machine-ben.
- ↑ Ningthoujam (2009. november 1.). „Antagonistic activities of local actinomycete isolates against rice fungal pathogens”. African Journal of Microbiology Research 3 (11), 737–742. o.
- ↑ (2013) „Metagenomics uncovers a new group of low GC and ultra-small marine Actinobacteria”. Scientific Reports 3, 2471. o. DOI:10.1038/srep02471. PMID 23959135.
- ↑ Sussman: Oldest Plants, The Guardian, 2 May 2010
- ↑ It's Okay to be Smart • the oldest living thing in the world: These. . (Hozzáférés: 2018. július 13.)
- ↑ Johnson (2007). „Ancient bacteria show evidence of DNA repair”. Proceedings of the National Academy of Sciences 104 (36), 14401–14405. o. DOI:10.1073/pnas.0706787104. PMID 17728401.
- ↑ Mahajan (2012). „Antibacterial agents from actinomycetes - a review”. Frontiers in Bioscience 4, 240–53. o. DOI:10.2741/e373.
- ↑ Gupte (2002). „Antifungal Antibiotics”. Appl. Microbiol. Biotechnol. 58 (1), 46–57. o. DOI:10.1007/s002530100822. PMID 11831475.
- ↑ Bressan (2003). „Biological control of maize seed pathogenic fungi by use of actinomycetes”. Biocontrol 48 (2), 233–240. o. DOI:10.1023/a:1022673226324.
- ↑ Atta (2009). „Antimycin-A Antibiotic Biosynthesis Produced by Streptomyces Sp. AZ-AR-262: Taxonomy, Fermentation, Purification and Biological Activities”. Austral. J. Basic and Appl. Sci. 3, 126–135. o.
- ↑ Ventura (2007. szeptember 5.). „Genomics of Actinobacteria: Tracing the Evolutionary History of an Ancient Phylum”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 71 (3), 495–548. o. DOI:10.1128/MMBR.00005-07. PMID 17804669.
- ↑ (2012) „Breaking a paradigm:cosmopolitan and abundant freshwater actinobacteria are low GC”. Environmental Microbiology Reports 4 (1), 29–35. o. DOI:10.1111/j.1758-2229.2011.00274.x. PMID 23757226.
- ↑ (2009) „Glutamine synthetase sequence evolution in the mycobacteria and their use as molecular markers for Actinobacteria speciation”. BMC Evol. Biol. 9, 48. o. DOI:10.1186/1471-2148-9-48. PMID 19245690.
További információk
- (2004) „Studies on the antibacterial activity of the Actinomycetes isolated from the Khumbu Region of Nepal”. International Conference on the Great Himalayas: Climate, Health, Ecology, Management and Conservation. . Hozzáférés: 2021. február 27.
- Baltz (2005). „Antibiotic discovery from actinomycetes: Will a renaissance follow the decline and fall?”. SIM News 55, 186–196. o.
- Baltz (2007). „Antimicrobials from Actinomycetes: Back to the Future”. Microbe 2 (3), 125–131. o. .
Fordítás
Ez a szócikk részben vagy egészben az Actinobacteria című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.